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1、技术介绍
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA。通过转录组测序,能够全面获得物种特定组织或器官的转录本信息,从而进行转录本结构研究、变异研究、基因表达水平研究以及全新转录本发现等研究。
我公司提供的转录组测序服务有:
1) 有参考基因组的转录组测序
2) 链特异性转录组测序
3) lncRNA测序
4) 环状RNA测序
5) small RNA测序
6) 新物种de novo 转录组测序
7) 新物种均一化cDNA文库转录组测序
有参考基因组的转录组测序
这里的转录组测序指狭义的mRNA测序。mRNA测序是转录组测序中非常重要的内容,可以真实的反映基因的表达调控信息。晶能生物可以提供各类真核和原核物种的mRNA测序服务,通过测序可以快速获得完整的mRNA信息,从而进行各类相关研究。
技术优势:
1) 保真性好:可以更加真实的反映基因表达信息,方便进行基因差异表达、新基因发现等研究;
2) 可靠性强:高数据量保证不同丰度的转录本都能准确定量。
2、技术路线
3、样品要求
1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。
2)样品的量:细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,RNA样品请提供2 μg以上的总RNA。
3)样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥
500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。