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技术介绍
当机体受到外源性入侵时,免疫系统会召集所有免疫细胞亚群通过产生免疫反应与病原体进行对抗。由于病原体存在多种多样的差异,因而相应产生的免疫反应和和每个阶段内涉及的细胞类型也有所不同
T细胞受体中V(D)J基因区域的随机重排,导致了T细胞种类的复杂多样化;这种多样化使T细胞在识别和杀伤特异外源性抗原时则更为快速、准确和有效。
10x Genomics,V(D)J测序
能够逐个对细胞组装全长V(D)J序列,揭示免疫谱的真实克隆性和多样性。
目前,可用于分析100至100,000个人类T细胞的全长配对V(D)J转录本。
B细胞正在研发中,敬请期待。
可上样细胞:
o 淋巴细胞,外周血单核细胞和T细胞系[B细胞正在研发中]
o FACS分离的T细胞
o MACS®MicroBead富集T细胞
o 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)
10x V(D)J测序优势
o 一次测序可同时上8个样本,每个样本可以捕获几千个细胞
o 相对于其他平台,单细胞测序的成本较低
o 无需分选细胞,就可实现单细胞测序
o 更小的测序偏好性:
不使用V-或J-特异性引物,避免多重PCR的偏好性
UMI序列进一步降低偏好性,并能够对转录本进行定量
o 更多的发现:
可检测整个V(D)J区段的生殖系和体细胞突变
可检测各种重组事件
可检测每个细胞中多种TCR α基因的表达情况
可覆盖转录起始位点
o 为其他转录本的细胞分型和表型分析提供可能。